Top-Down蛋白质测序

自上而下测序（Top-down sequencing; TDS）大大扩展了布鲁克质谱分析的适用范围。Top-down测序甚至可以对分子量较大的未酶解蛋白直接读出序列。对于用传统的胰酶酶解很难检测到的化学修饰、翻译后修饰、突变和蛋白质异构的检测与定位来说，这是一个有力的工具。

Top-down测序也可以用来鉴定蛋白质末端序列，完成Edman测序技术的工作。